Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
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PUM3Q15397 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
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PUM3Q15397 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
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