Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
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PTPRKQ15262 AC008759.3-201ENST00000613300 508 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRKQ15262 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
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PTPRKQ15262 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
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PTPRKQ15262 AL353148.1-203ENST00000452286 665 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPRKQ15262 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
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PTPRKQ15262 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPRKQ15262 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPRKQ15262 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPRKQ15262 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPRKQ15262 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPRKQ15262 AC068880.4-201ENST00000623082 495 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPRKQ15262 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPRKQ15262 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
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PTPRKQ15262 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
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PTPRKQ15262 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRKQ15262 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRKQ15262 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRKQ15262 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRKQ15262 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRKQ15262 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRKQ15262 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRKQ15262 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRKQ15262 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRKQ15262 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRKQ15262 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRKQ15262 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRKQ15262 AC118942.1-201ENST00000529674 1035 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRKQ15262 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
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