Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC0.78□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC0.77□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 ZNF736P6Y-201ENST00000447526 1213 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 AC008379.1-201ENST00000463655 464 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC0.77□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC0.77□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC0.76□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 AL365184.1-201ENST00000413801 572 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC0.76□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 AC111000.5-201ENST00000506559 1178 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC0.76□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 BX322635.1-201ENST00000605804 496 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC0.75□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC0.75□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC0.75□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 AC010615.3-201ENST00000597319 394 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC0.74□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.74□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.73□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC0.73□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 HAUS1P3-201ENST00000523909 662 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.72□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 SNORA63.3-201ENST00000362682 132 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.72□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SHPRHQ149N8 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.4 ms