Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC4.25□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC4.25□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC4.24□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
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