| RUNX2 | Q13950 | LINC02377-202 | ENST00000505436 | 523 nt | TSL 5 BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC01333-201 | ENST00000508083 | 724 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC145146.2-202 | ENST00000508118 | 326 nt | TSL 3 BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU4ATAC15P-201 | ENST00000516415 | 126 nt | BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-703P-201 | ENST00000516946 | 107 nt | BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MTND4P7-201 | ENST00000523876 | 130 nt | BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC013799.1-201 | ENST00000531157 | 348 nt | TSL 2 BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC02309-201 | ENST00000553679 | 207 nt | TSL 3 BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC02305-201 | ENST00000554142 | 476 nt | TSL 3 BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL391261.3-201 | ENST00000557194 | 520 nt | BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX2 | Q13950 | H3F3AP1-201 | ENST00000559984 | 334 nt | BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC007948.1-201 | ENST00000581632 | 242 nt | TSL 5 BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX2 | Q13950 | C8orf59-208 | ENST00000612809 | 475 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC006504.8-201 | ENST00000621046 | 635 nt | BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC007405.1-203 | ENST00000623667 | 932 nt | TSL 5 BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CNOT1-223 | ENST00000628857 | 291 nt | TSL 5 BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ACTR6-212 | ENST00000552376 | 1659 nt | TSL 5 BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX2 | Q13950 | VPS13C-203 | ENST00000395896 | 14579 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LUZP2-208 | ENST00000620308 | 4981 nt | TSL 5 BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MBNL3-205 | ENST00000370857 | 8760 nt | TSL 5 BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX2 | Q13950 | OXR1-207 | ENST00000497705 | 2007 nt | TSL 2 BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC110774.1-201 | ENST00000623567 | 2018 nt | BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.303-201 | ENST00000364998 | 94 nt | BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.378-201 | ENST00000365652 | 113 nt | BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR483-201 | ENST00000385070 | 76 nt | BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TRAV39-201 | ENST00000390466 | 331 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TRAJ40-201 | ENST00000390497 | 61 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-1148P-201 | ENST00000410992 | 104 nt | BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX2 | Q13950 | BX682237.1-201 | ENST00000415016 | 335 nt | BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPL21P90-201 | ENST00000415692 | 466 nt | BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL355989.1-202 | ENST00000419406 | 408 nt | TSL 3 BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC005482.1-201 | ENST00000420758 | 575 nt | TSL 4 BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL592466.1-201 | ENST00000428346 | 307 nt | TSL 5 BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC005326.1-201 | ENST00000429197 | 123 nt | BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MTCO3P18-201 | ENST00000440206 | 761 nt | BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Z75741.1-201 | ENST00000446793 | 314 nt | BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC00971-201 | ENST00000482721 | 535 nt | TSL 2 BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PPP2R2B-IT1-201 | ENST00000505921 | 447 nt | TSL 3 BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MEPE-206 | ENST00000511670 | 550 nt | TSL 4 BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.665-201 | ENST00000516177 | 98 nt | BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA31.21-201 | ENST00000517180 | 77 nt | BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC068880.3-201 | ENST00000519185 | 179 nt | TSL 5 BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC025755.1-201 | ENST00000521306 | 278 nt | BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC134698.4-201 | ENST00000523451 | 826 nt | BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CENPUP1-201 | ENST00000526649 | 1202 nt | BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX2 | Q13950 | BNIP3P6-201 | ENST00000549284 | 499 nt | BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX2 | Q13950 | OR11H5P-201 | ENST00000554039 | 926 nt | BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC090607.4-201 | ENST00000558192 | 369 nt | TSL 3 BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC010928.1-202 | ENST00000589354 | 473 nt | TSL 3 BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC012468.1-201 | ENST00000604888 | 430 nt | BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC105265.4-201 | ENST00000618391 | 306 nt | TSL 5 BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CYP3A43-217 | ENST00000631161 | 328 nt | TSL 5 BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ZNF804A-202 | ENST00000613975 | 3986 nt | TSL 5 BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MTND4P14-201 | ENST00000435799 | 1354 nt | BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC007496.3-201 | ENST00000624987 | 3443 nt | BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | OR6C1-202 | ENST00000642104 | 2055 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | OXR1-206 | ENST00000449762 | 2621 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TRDN-201 | ENST00000334268 | 4770 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ZCCHC10-201 | ENST00000324170 | 2178 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC008669.1-201 | ENST00000565823 | 2178 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | OR51L1-203 | ENST00000641819 | 7300 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PTBP2-211 | ENST00000609116 | 12014 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TECRL-202 | ENST00000507440 | 2876 nt | TSL 5 BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MKLN1-201 | ENST00000352689 | 11156 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CASP1-201 | ENST00000353247 | 423 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | U3.12-201 | ENST00000364498 | 214 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-1303P-201 | ENST00000364841 | 107 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-395P-201 | ENST00000365662 | 106 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MDM4-202 | ENST00000367180 | 547 nt | TSL 3 BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.399-201 | ENST00000383955 | 105 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-45P-201 | ENST00000384471 | 107 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-393P-201 | ENST00000384475 | 107 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TRAV26-1-201 | ENST00000390455 | 537 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-332P-201 | ENST00000391193 | 108 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA40C-201 | ENST00000391285 | 128 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL357075.1-201 | ENST00000404107 | 726 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNA5SP118-201 | ENST00000410385 | 109 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.615-201 | ENST00000410769 | 117 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNA5SP229-201 | ENST00000410809 | 99 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | NDUFS5P4-201 | ENST00000412983 | 318 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL590705.3-201 | ENST00000416066 | 474 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | HSPE1P1-201 | ENST00000421494 | 318 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPL21P40-201 | ENST00000428586 | 483 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ERLEC1P1-201 | ENST00000433806 | 578 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL031183.1-201 | ENST00000457667 | 207 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPL31P58-201 | ENST00000469001 | 379 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC091885.1-201 | ENST00000506658 | 268 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PRDX4P1-201 | ENST00000507189 | 574 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MTND3P25-201 | ENST00000509243 | 135 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC104136.1-201 | ENST00000512969 | 394 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LRRC34P2-201 | ENST00000514850 | 553 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU1-86P-201 | ENST00000516108 | 154 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU1-107P-201 | ENST00000516617 | 154 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA70.24-201 | ENST00000517233 | 118 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AF235103.2-201 | ENST00000525753 | 346 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MRPL51-203 | ENST00000538814 | 501 nt | TSL 2 BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC007619.1-201 | ENST00000544086 | 412 nt | TSL 5 BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC090115.3-201 | ENST00000553218 | 849 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | DNAJC8P1-201 | ENST00000554535 | 372 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC02328-203 | ENST00000557195 | 682 nt | TSL 3 BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |