Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC3.69□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.68□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
GTF2H3Q13889 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.3 ms