Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
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PKP1Q13835 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
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PKP1Q13835 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
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PKP1Q13835 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PKP1Q13835 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
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