Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.38□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ATP1A4Q13733 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
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