Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NEUROD1Q13562 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.4 ms