Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 CTNND1-214ENST00000526772 4966 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 SLC4A8-202ENST00000358657 11731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 NHS-205ENST00000617601 8163 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 AC044860.2-201ENST00000561005 179 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 OR2AG1-202ENST00000641258 6993 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 GFPT1-202ENST00000361060 8632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 FLG-201ENST00000368799 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 DPCR1-202ENST00000462446 5314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.7 ms