Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SEMA3FQ13275 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SEMA3FQ13275 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SEMA3FQ13275 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SEMA3FQ13275 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SEMA3FQ13275 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SEMA3FQ13275 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SEMA3FQ13275 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SEMA3FQ13275 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SEMA3FQ13275 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SEMA3FQ13275 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SEMA3FQ13275 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SEMA3FQ13275 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SEMA3FQ13275 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
SEMA3FQ13275 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 AC013565.1-201ENST00000565938 597 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SEMA3FQ13275 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
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