Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
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NR1H3Q13133 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
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NR1H3Q13133 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
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NR1H3Q13133 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
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NR1H3Q13133 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
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NR1H3Q13133 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
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NR1H3Q13133 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
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NR1H3Q13133 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
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NR1H3Q13133 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
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NR1H3Q13133 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
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NR1H3Q13133 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NR1H3Q13133 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
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NR1H3Q13133 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
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NR1H3Q13133 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
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NR1H3Q13133 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
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NR1H3Q13133 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NR1H3Q13133 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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