Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.3 ms