Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC3.96□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
STRN3Q13033 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 204.7 ms