Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NFX1Q12986 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
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