Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 NBEA-207ENST00000537702 4089 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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FOXC1Q12948 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 LINC01450-201ENST00000443406 3263 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
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FOXC1Q12948 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
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FOXC1Q12948 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
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FOXC1Q12948 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
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FOXC1Q12948 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
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FOXC1Q12948 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXC1Q12948 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
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