Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.59□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 AL161616.2-201ENST00000622001 565 ntTSL 4 BASIC0.59□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC0.59□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC0.58□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC0.58□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC0.57□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 Y_RNA.228-201ENST00000364346 98 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC0.57□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 AC073111.2-201ENST00000605657 1075 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 LARP7P4-201ENST00000481075 878 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 C5orf46-203ENST00000515291 573 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC0.56□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 SNORA31.13-201ENST00000516624 135 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC0.56□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC0.56□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC0.56□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 RSL24D1P8-201ENST00000434442 492 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 AC099063.1-201ENST00000437128 324 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.56□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 AL713998.2-201ENST00000604538 1198 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 PHF11-215ENST00000488958 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.55□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
BPTFQ12830 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
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