Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ATP9BO43861 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.5 ms