Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC2.66□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.98
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
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HOXD1Q9GZZ0 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC2.65□□□□□ -1.99
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HOXD1Q9GZZ0 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
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HOXD1Q9GZZ0 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
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HOXD1Q9GZZ0 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.65□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
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