Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUT4

LRRN4, Leucine-rich repeat neuronal protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN4Q8WUT4 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 MIR6719-201ENST00000622428 87 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 FAR2P2-201ENST00000413041 594 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 CYP4F62P-203ENST00000455215 552 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LRRN4Q8WUT4 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.8 ms