Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ANKRD42Q8N9B4 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.5 ms