Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC3.75□□□□□ -1.81
GEN1Q17RS7 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
GEN1Q17RS7 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
GEN1Q17RS7 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
GEN1Q17RS7 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
GEN1Q17RS7 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
GEN1Q17RS7 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
GEN1Q17RS7 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
GEN1Q17RS7 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
GEN1Q17RS7 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
GEN1Q17RS7 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
GEN1Q17RS7 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.75□□□□□ -1.81
GEN1Q17RS7 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
GEN1Q17RS7 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
GEN1Q17RS7 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
GEN1Q17RS7 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GEN1Q17RS7 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GEN1Q17RS7 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
GEN1Q17RS7 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GEN1Q17RS7 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GEN1Q17RS7 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GEN1Q17RS7 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GEN1Q17RS7 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GEN1Q17RS7 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GEN1Q17RS7 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GEN1Q17RS7 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GEN1Q17RS7 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
GEN1Q17RS7 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GEN1Q17RS7 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
GEN1Q17RS7 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GEN1Q17RS7 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GEN1Q17RS7 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
GEN1Q17RS7 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GEN1Q17RS7 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GEN1Q17RS7 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GEN1Q17RS7 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
GEN1Q17RS7 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
GEN1Q17RS7 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GEN1Q17RS7 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GEN1Q17RS7 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
GEN1Q17RS7 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GEN1Q17RS7 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
GEN1Q17RS7 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GEN1Q17RS7 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GEN1Q17RS7 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GEN1Q17RS7 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GEN1Q17RS7 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GEN1Q17RS7 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
GEN1Q17RS7 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GEN1Q17RS7 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
GEN1Q17RS7 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
GEN1Q17RS7 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
GEN1Q17RS7 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
GEN1Q17RS7 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
GEN1Q17RS7 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
GEN1Q17RS7 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
GEN1Q17RS7 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
GEN1Q17RS7 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
GEN1Q17RS7 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
GEN1Q17RS7 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
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GEN1Q17RS7 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
GEN1Q17RS7 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
GEN1Q17RS7 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
GEN1Q17RS7 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
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GEN1Q17RS7 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
GEN1Q17RS7 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
GEN1Q17RS7 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
GEN1Q17RS7 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
GEN1Q17RS7 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
GEN1Q17RS7 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
GEN1Q17RS7 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC3.73□□□□□ -1.81
GEN1Q17RS7 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
GEN1Q17RS7 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
GEN1Q17RS7 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
GEN1Q17RS7 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
GEN1Q17RS7 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
GEN1Q17RS7 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
GEN1Q17RS7 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
GEN1Q17RS7 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
GEN1Q17RS7 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
GEN1Q17RS7 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
GEN1Q17RS7 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
GEN1Q17RS7 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
GEN1Q17RS7 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
GEN1Q17RS7 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
GEN1Q17RS7 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
GEN1Q17RS7 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
GEN1Q17RS7 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
GEN1Q17RS7 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
GEN1Q17RS7 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
GEN1Q17RS7 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
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