Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
DDB1Q16531 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
DDB1Q16531 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
DDB1Q16531 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
DDB1Q16531 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC4.27□□□□□ -1.73
DDB1Q16531 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
DDB1Q16531 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
DDB1Q16531 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
DDB1Q16531 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
DDB1Q16531 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
DDB1Q16531 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
DDB1Q16531 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
DDB1Q16531 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
DDB1Q16531 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
DDB1Q16531 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
DDB1Q16531 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
DDB1Q16531 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
DDB1Q16531 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
DDB1Q16531 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
DDB1Q16531 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
DDB1Q16531 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
DDB1Q16531 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
DDB1Q16531 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
DDB1Q16531 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
DDB1Q16531 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
DDB1Q16531 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
DDB1Q16531 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
DDB1Q16531 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
DDB1Q16531 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
DDB1Q16531 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
DDB1Q16531 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
DDB1Q16531 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
DDB1Q16531 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
DDB1Q16531 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
DDB1Q16531 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
DDB1Q16531 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
DDB1Q16531 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
DDB1Q16531 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
DDB1Q16531 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
DDB1Q16531 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
DDB1Q16531 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
DDB1Q16531 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
DDB1Q16531 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
DDB1Q16531 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
DDB1Q16531 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
DDB1Q16531 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
DDB1Q16531 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
DDB1Q16531 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
DDB1Q16531 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
DDB1Q16531 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
DDB1Q16531 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
DDB1Q16531 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
DDB1Q16531 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
DDB1Q16531 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
DDB1Q16531 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
DDB1Q16531 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
DDB1Q16531 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
DDB1Q16531 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
DDB1Q16531 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
DDB1Q16531 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
DDB1Q16531 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
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DDB1Q16531 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
DDB1Q16531 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
DDB1Q16531 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
DDB1Q16531 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
DDB1Q16531 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
DDB1Q16531 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
DDB1Q16531 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
DDB1Q16531 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
DDB1Q16531 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
DDB1Q16531 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
DDB1Q16531 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
DDB1Q16531 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
DDB1Q16531 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
DDB1Q16531 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
DDB1Q16531 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
DDB1Q16531 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
DDB1Q16531 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
DDB1Q16531 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
DDB1Q16531 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
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DDB1Q16531 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
DDB1Q16531 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
DDB1Q16531 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
DDB1Q16531 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
DDB1Q16531 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
DDB1Q16531 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC4.25□□□□□ -1.73
DDB1Q16531 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
DDB1Q16531 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
DDB1Q16531 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
DDB1Q16531 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
DDB1Q16531 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
DDB1Q16531 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
DDB1Q16531 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
DDB1Q16531 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
DDB1Q16531 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
DDB1Q16531 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
DDB1Q16531 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
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