Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.48
E2F4Q16254 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 RN7SL174P-201ENST00000475578 289 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 MIR4310-201ENST00000582950 57 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
E2F4Q16254 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96 ms