Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
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GRIK4Q16099 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
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GRIK4Q16099 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
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GRIK4Q16099 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
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GRIK4Q16099 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
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GRIK4Q16099 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
GRIK4Q16099 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
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GRIK4Q16099 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
GRIK4Q16099 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
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GRIK4Q16099 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
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GRIK4Q16099 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
GRIK4Q16099 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
GRIK4Q16099 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
GRIK4Q16099 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
GRIK4Q16099 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
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GRIK4Q16099 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
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GRIK4Q16099 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
GRIK4Q16099 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
GRIK4Q16099 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
GRIK4Q16099 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
GRIK4Q16099 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
GRIK4Q16099 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
GRIK4Q16099 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
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