Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC0.93□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 AC108729.2-201ENST00000476543 840 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC0.93□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC0.92□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.92□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 AL121882.1-201ENST00000422893 417 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC0.92□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 AC108733.1-201ENST00000479244 705 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 LINC01612-201ENST00000504509 469 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC0.92□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 CYB5AP5-201ENST00000549779 389 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 AC090519.2-201ENST00000559034 655 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC0.92□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC0.92□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
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NEDD8Q15843 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
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NEDD8Q15843 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
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NEDD8Q15843 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
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NEDD8Q15843 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
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NEDD8Q15843 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
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NEDD8Q15843 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 LINC01495-201ENST00000532380 421 ntTSL 2 BASIC0.91□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 AP005229.2-201ENST00000609980 697 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
NEDD8Q15843 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
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