Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 OR5H14-202ENST00000641380 7323 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 BTAF1-204ENST00000544642 6938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
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