Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 AL450344.2-201ENST00000455229 614 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 OR9N1P-202ENST00000494289 481 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 AC007906.1-201ENST00000568648 510 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 ZRANB2-AS2-212ENST00000590186 686 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 AC090617.9-201ENST00000623751 147 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 RPL22P22-201ENST00000395439 379 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC0.92□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC0.92□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 AC092634.2-201ENST00000428146 1010 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 RPL23AP23-201ENST00000452590 471 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 RAD1P2-201ENST00000446414 663 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 AC092902.1-201ENST00000486999 259 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC0.9□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC0.89□□□□□ -2.27
SMCO1Q147U7 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
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