Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 BTAF1-204ENST00000544642 6938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.74
SMAD4Q13485 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
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