Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXE3Q13461 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
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