Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 TRPM6-202ENST00000360774 8425 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
MKRN4PQ13434 DNAH17-201ENST00000389840 13723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 RAB3B-201ENST00000371655 12844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 HMGA1P8-201ENST00000414130 321 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 MYO5A-209ENST00000553916 5989 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 AL590399.4-201ENST00000436561 601 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
MKRN4PQ13434 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
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