Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
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PTGDRQ13258 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
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PTGDRQ13258 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
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PTGDRQ13258 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
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PTGDRQ13258 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PTGDRQ13258 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
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