Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
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ECH1Q13011 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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ECH1Q13011 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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