Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
BPTFQ12830 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC0.65□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 Y_RNA.684-201ENST00000516510 99 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 RNY4P7-201ENST00000364600 96 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC0.64□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 SNORA63.3-201ENST00000362682 132 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC0.63□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 LINC02027-201ENST00000482617 596 ntTSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC0.63□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC0.63□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 AL391834.1-201ENST00000609609 560 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 AL118508.4-201ENST00000624142 1176 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 AC015726.3-201ENST00000624501 418 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC0.62□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC0.62□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 C1DP3-201ENST00000455013 423 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 RNU6-362P-201ENST00000516736 90 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC0.61□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC0.61□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 LINC00557-201ENST00000563184 1279 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 AC092474.3-201ENST00000603022 568 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC0.61□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 AC012361.1-201ENST00000447260 1498 ntTSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 AC114284.1-201ENST00000511422 1114 ntTSL 2 BASIC0.6□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC0.6□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
BPTFQ12830 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.6 ms