Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SH3BP2P78314 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.3 ms