Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms