Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU7

CABP1, Calcium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP1Q9NZU7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CABP1Q9NZU7 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CABP1Q9NZU7 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CABP1Q9NZU7 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CABP1Q9NZU7 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CABP1Q9NZU7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CABP1Q9NZU7 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CABP1Q9NZU7 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CABP1Q9NZU7 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CABP1Q9NZU7 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CABP1Q9NZU7 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CABP1Q9NZU7 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CABP1Q9NZU7 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CABP1Q9NZU7 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CABP1Q9NZU7 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CABP1Q9NZU7 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CABP1Q9NZU7 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CABP1Q9NZU7 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CABP1Q9NZU7 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CABP1Q9NZU7 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CABP1Q9NZU7 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CABP1Q9NZU7 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CABP1Q9NZU7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CABP1Q9NZU7 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CABP1Q9NZU7 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CABP1Q9NZU7 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CABP1Q9NZU7 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CABP1Q9NZU7 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CABP1Q9NZU7 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CABP1Q9NZU7 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CABP1Q9NZU7 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CABP1Q9NZU7 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CABP1Q9NZU7 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CABP1Q9NZU7 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CABP1Q9NZU7 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CABP1Q9NZU7 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CABP1Q9NZU7 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CABP1Q9NZU7 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CABP1Q9NZU7 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CABP1Q9NZU7 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CABP1Q9NZU7 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CABP1Q9NZU7 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CABP1Q9NZU7 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CABP1Q9NZU7 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CABP1Q9NZU7 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CABP1Q9NZU7 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CABP1Q9NZU7 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CABP1Q9NZU7 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CABP1Q9NZU7 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CABP1Q9NZU7 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CABP1Q9NZU7 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CABP1Q9NZU7 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CABP1Q9NZU7 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CABP1Q9NZU7 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CABP1Q9NZU7 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CABP1Q9NZU7 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CABP1Q9NZU7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CABP1Q9NZU7 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CABP1Q9NZU7 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CABP1Q9NZU7 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CABP1Q9NZU7 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CABP1Q9NZU7 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CABP1Q9NZU7 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CABP1Q9NZU7 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CABP1Q9NZU7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CABP1Q9NZU7 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CABP1Q9NZU7 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CABP1Q9NZU7 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CABP1Q9NZU7 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CABP1Q9NZU7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CABP1Q9NZU7 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CABP1Q9NZU7 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CABP1Q9NZU7 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CABP1Q9NZU7 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CABP1Q9NZU7 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CABP1Q9NZU7 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CABP1Q9NZU7 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CABP1Q9NZU7 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CABP1Q9NZU7 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CABP1Q9NZU7 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CABP1Q9NZU7 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CABP1Q9NZU7 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CABP1Q9NZU7 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CABP1Q9NZU7 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CABP1Q9NZU7 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CABP1Q9NZU7 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CABP1Q9NZU7 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CABP1Q9NZU7 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CABP1Q9NZU7 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CABP1Q9NZU7 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CABP1Q9NZU7 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CABP1Q9NZU7 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CABP1Q9NZU7 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CABP1Q9NZU7 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CABP1Q9NZU7 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CABP1Q9NZU7 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CABP1Q9NZU7 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CABP1Q9NZU7 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CABP1Q9NZU7 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CABP1Q9NZU7 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms