Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0D2

ZNF541, Zinc finger protein 541, humanhuman

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF541Q9H0D2 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF541Q9H0D2 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF541Q9H0D2 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms