Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDGFDQ9GZP0 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms