Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K0

BCL11B, B-cell lymphoma/leukemia 11B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL11BQ9C0K0 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BCL11BQ9C0K0 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BCL11BQ9C0K0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BCL11BQ9C0K0 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BCL11BQ9C0K0 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BCL11BQ9C0K0 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BCL11BQ9C0K0 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BCL11BQ9C0K0 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BCL11BQ9C0K0 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
BCL11BQ9C0K0 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BCL11BQ9C0K0 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
BCL11BQ9C0K0 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BCL11BQ9C0K0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BCL11BQ9C0K0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BCL11BQ9C0K0 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BCL11BQ9C0K0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BCL11BQ9C0K0 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BCL11BQ9C0K0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BCL11BQ9C0K0 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BCL11BQ9C0K0 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BCL11BQ9C0K0 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
BCL11BQ9C0K0 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BCL11BQ9C0K0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BCL11BQ9C0K0 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BCL11BQ9C0K0 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BCL11BQ9C0K0 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BCL11BQ9C0K0 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BCL11BQ9C0K0 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BCL11BQ9C0K0 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BCL11BQ9C0K0 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BCL11BQ9C0K0 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BCL11BQ9C0K0 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BCL11BQ9C0K0 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BCL11BQ9C0K0 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BCL11BQ9C0K0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BCL11BQ9C0K0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BCL11BQ9C0K0 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BCL11BQ9C0K0 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BCL11BQ9C0K0 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
BCL11BQ9C0K0 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BCL11BQ9C0K0 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BCL11BQ9C0K0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BCL11BQ9C0K0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BCL11BQ9C0K0 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BCL11BQ9C0K0 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BCL11BQ9C0K0 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BCL11BQ9C0K0 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BCL11BQ9C0K0 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
BCL11BQ9C0K0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BCL11BQ9C0K0 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BCL11BQ9C0K0 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BCL11BQ9C0K0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BCL11BQ9C0K0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BCL11BQ9C0K0 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BCL11BQ9C0K0 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BCL11BQ9C0K0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BCL11BQ9C0K0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BCL11BQ9C0K0 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BCL11BQ9C0K0 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BCL11BQ9C0K0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BCL11BQ9C0K0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BCL11BQ9C0K0 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BCL11BQ9C0K0 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BCL11BQ9C0K0 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BCL11BQ9C0K0 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BCL11BQ9C0K0 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BCL11BQ9C0K0 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BCL11BQ9C0K0 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BCL11BQ9C0K0 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BCL11BQ9C0K0 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BCL11BQ9C0K0 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BCL11BQ9C0K0 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BCL11BQ9C0K0 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BCL11BQ9C0K0 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BCL11BQ9C0K0 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
BCL11BQ9C0K0 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BCL11BQ9C0K0 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BCL11BQ9C0K0 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BCL11BQ9C0K0 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BCL11BQ9C0K0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BCL11BQ9C0K0 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BCL11BQ9C0K0 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BCL11BQ9C0K0 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
BCL11BQ9C0K0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BCL11BQ9C0K0 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BCL11BQ9C0K0 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BCL11BQ9C0K0 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BCL11BQ9C0K0 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BCL11BQ9C0K0 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
BCL11BQ9C0K0 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BCL11BQ9C0K0 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BCL11BQ9C0K0 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BCL11BQ9C0K0 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms