Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ALS2CR12Q96Q35 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALS2CR12Q96Q35 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms