Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms