Protein–RNA interactions for Protein: Q86XT2

VPS37D, Vacuolar protein sorting-associated protein 37D, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37DQ86XT2 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VPS37DQ86XT2 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms