Protein–RNA interactions for Protein: Q86WU2

LDHD, Probable D-lactate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDHDQ86WU2 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
LDHDQ86WU2 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LDHDQ86WU2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LDHDQ86WU2 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LDHDQ86WU2 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LDHDQ86WU2 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LDHDQ86WU2 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LDHDQ86WU2 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LDHDQ86WU2 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LDHDQ86WU2 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LDHDQ86WU2 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LDHDQ86WU2 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LDHDQ86WU2 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LDHDQ86WU2 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LDHDQ86WU2 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LDHDQ86WU2 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LDHDQ86WU2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LDHDQ86WU2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LDHDQ86WU2 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LDHDQ86WU2 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LDHDQ86WU2 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LDHDQ86WU2 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LDHDQ86WU2 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LDHDQ86WU2 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LDHDQ86WU2 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LDHDQ86WU2 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LDHDQ86WU2 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LDHDQ86WU2 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LDHDQ86WU2 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LDHDQ86WU2 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LDHDQ86WU2 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LDHDQ86WU2 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LDHDQ86WU2 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LDHDQ86WU2 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LDHDQ86WU2 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LDHDQ86WU2 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LDHDQ86WU2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LDHDQ86WU2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LDHDQ86WU2 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LDHDQ86WU2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LDHDQ86WU2 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LDHDQ86WU2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LDHDQ86WU2 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LDHDQ86WU2 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LDHDQ86WU2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LDHDQ86WU2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LDHDQ86WU2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LDHDQ86WU2 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LDHDQ86WU2 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LDHDQ86WU2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LDHDQ86WU2 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LDHDQ86WU2 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LDHDQ86WU2 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LDHDQ86WU2 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LDHDQ86WU2 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LDHDQ86WU2 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms