Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z404

TMC4, Transmembrane channel-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC4Q7Z404 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMC4Q7Z404 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMC4Q7Z404 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms