Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y8

KRT27, Keratin, type I cytoskeletal 27, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT27Q7Z3Y8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT27Q7Z3Y8 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms