Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTF1AQ7RTS3 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms