Protein–RNA interactions for Protein: Q6YHK3

CD109, CD109 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD109Q6YHK3 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CD109Q6YHK3 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CD109Q6YHK3 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CD109Q6YHK3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CD109Q6YHK3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CD109Q6YHK3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CD109Q6YHK3 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CD109Q6YHK3 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CD109Q6YHK3 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CD109Q6YHK3 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CD109Q6YHK3 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CD109Q6YHK3 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CD109Q6YHK3 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CD109Q6YHK3 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CD109Q6YHK3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CD109Q6YHK3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CD109Q6YHK3 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CD109Q6YHK3 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CD109Q6YHK3 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CD109Q6YHK3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CD109Q6YHK3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CD109Q6YHK3 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CD109Q6YHK3 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CD109Q6YHK3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CD109Q6YHK3 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CD109Q6YHK3 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CD109Q6YHK3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CD109Q6YHK3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CD109Q6YHK3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CD109Q6YHK3 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CD109Q6YHK3 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CD109Q6YHK3 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CD109Q6YHK3 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
CD109Q6YHK3 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CD109Q6YHK3 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CD109Q6YHK3 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
CD109Q6YHK3 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
CD109Q6YHK3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CD109Q6YHK3 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CD109Q6YHK3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CD109Q6YHK3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CD109Q6YHK3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CD109Q6YHK3 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms