Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAF7Q6Q0C0 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAF7Q6Q0C0 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms