Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
NHSL1Q5SYE7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms